В случае отключения электроэнергии нужно ограничить потребление воды во избежание переполнения приёмной камеры. Если электричество отключилось менее чем на 6 часов, на работе станции это никак не отразится. Если электроэнергию отключили более чем на сутки, то первое время вода из станции может идти немного мутноватая, но через 2 недели станция выходит на нормальный рабочий режим.

Каждое очистное сооружение способно переработать чётко регламентированный объём сточных вод. В зависимости от этого различаются объёмы приёмных камер и производительность станций. Любое превышение объёма залпового сброса может привести к переполнению приёмной камеры и, как следствие, к выбросу неочищенных сточных вод и вымыванию активного ила из станции.

В очистное сооружение не допускается сброс очистков от грибов и овощей. Нельзя выбрасывать в унитаз заплесневелые продукты. Не допускается попадание в септик бензина, кислот, щелочей, и прочих агрессивных жидкостей.

Большинство очистных систем имеют конструкцию, предполагающую возможность выполнения очистки самостоятельно. Перечень необходимых работ и порядок действия при обслуживании станции отображаются в инструкции пользователя, поставляемой с каждым комплектом оборудования. Обычно первый раз техническое обслуживание новой очистной системы владельцы доверяют специалистам. Но, убедившись, что такие работы не требуют специфических знаний и навыков в дальнейшем стараются выполнять их без участия оплачиваемых сотрудников.

Современные станции биологической очистки абсолютно не боятся высоких грунтовых вод. Весь процесс очистки в таких септиках происходит в полностью герметичном корпусе.